Η βιοαιθανόλη χρησιμοποιείται όλο και περισσότερο ως καύσιμο σε ορισμένες περιοχές. Ένας από τους πιο γνωστούς τομείς στους οποίους χρησιμοποιείται η βιοαιθανόλη είναι ως εναλλακτικό καύσιμο για τα αυτοκίνητα. Σε ορισμένα μέρη του κόσμου, η βιοαιθανόλη χρησιμοποιείται ως κύριο καύσιμο για τους βενζινοκινητήρες από τη δεκαετία του 1970, αλλά στις Κάτω Χώρες δεν συναντώνται ευρέως αυτοκίνητα προσαρμοσμένα για να λειτουργούν με βιοαιθανόλη ή μείγματα βενζίνης με υψηλή περιεκτικότητα σε βιοαιθανόλη. Στις ΗΠΑ και το Ηνωμένο Βασίλειο, χρησιμοποιούνται όλο και περισσότερο μείγματα όπως το E10 με περιεκτικότητα σε βιοαιθανόλη 10% αναμεμειγμένο με αμόλυβδη βενζίνη, το οποίο μπορεί να λειτουργήσει από κανονικούς βενζινοκινητήρες χωρίς προβλήματα.

Στο σπίτι, η βιοαιθανόλη αντικαθιστά άλλους τύπους καυσίμων για χρήση σε ανοιχτές φωτιές. Οι φωτιές βιοαιθανόλης φαίνονται ελκυστικές με τις πραγματικές πορτοκαλί φλόγες τους, αλλά δεν παράγουν καπνό ή στάχτη. Αυτό τις καθιστά πιο βολικές και πιο εύκολες στην εγκατάσταση από άλλους τύπους φωτιάς, ενώ το γεγονός ότι η βιοαιθανόλη είναι ουδέτερη ως προς τον άνθρακα, έχει χαμηλή τοξικότητα και είναι βιοδιασπώμενη την καθιστά ελκυστική επιλογή και από περιβαλλοντική άποψη. Οι φωτιές βιοαιθανόλης μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν σε εξωτερικούς χώρους, γεγονός που τις καθιστά μια καλή εναλλακτική λύση σε σχέση με άλλες μορφές φωτισμού και θέρμανσης σε εξωτερικούς χώρους.