在某些地区,生物乙醇正越来越多地被用作燃料。生物乙醇被使用的最著名领域之一是作为汽车的替代燃料。在世界一些地方,自20世纪70年代以来,生物乙醇已被用作汽油发动机的主要燃料,但在荷兰,适合使用生物乙醇的汽车或生物乙醇含量高的汽油混合燃料并不广泛。在美国和英国,诸如生物乙醇含量为10%的E10混合物与无铅汽油混合使用的情况越来越多,正常的汽油发动机可以毫无问题地运行。

在家里,生物乙醇取代了其他类型的燃料,用于明火。生物乙醇火看起来很吸引人,有真正的橙色火焰,但不产生烟或灰。这使得它们比其他类型的火灾更方便,更容易安装,而且生物乙醇是碳中性的,毒性低,可生物降解,从环境角度看也是一个有吸引力的选择。生物乙醇火也可以在户外使用,使其成为其他形式的户外照明和加热的良好替代品。